【神経・筋】ギラン・バレー症候群、重症筋無力症 、多発性硬化症 髄鞘 抗アクアポリン4抗体
【消化器】慢性胃炎、慢性萎縮性胃炎、自己免疫性肝炎、原発性胆汁性胆管炎、潰瘍性大腸炎、クローン病、原発性胆汁性胆管炎、自己免疫性膵炎
【循環器】高安動脈炎
【肺】グッドパスチャー症候群
【腎臓】急速進行性糸球体腎炎
【血液】巨赤芽球性貧血、自己免疫性溶血性貧血、自己免疫性好中球減少症、特発性血小板減少性紫斑病
【内分泌・代謝】バセドウ病、橋本病、原発性甲状腺機能低下症、特発性アジソン病 、1型糖尿病
【皮膚】慢性円板状エリテマトーデス、限局性強皮症 、天疱瘡、膿疱性乾癬、尋常性乾癬、類天疱瘡 、妊娠性疱疹、線状IgA水疱性皮膚症、後天性表皮水疱症、円形脱毛症、尋常性白斑、サットン後天性遠心性白斑・サットン母斑
【眼】原田病

自己免疫疾患の一覧。