【現時点までのまとめ】
@財務省が朝日に見せた文書Aと国会で配布された文書Bが「同じ番号なのに」内容が違った ←朝日新聞報道
A文書Bについて、チェック印がある部分と無い部分が存在する ←野党指摘
B文書Bと同じ内容の別文書C(当然別文書なら書類番号は違うはず)が存在した ←毎日新聞が指摘

・つまり文書Aの一部分を文書Cのものと差し替えて文書Bを作り、それをAとして国会に提出した疑惑があるということ
・Bの差し替え部分にチェック印が無いのは文書Cのデータから当該部分をコピーするなりしたからではないか

Cそして上西ツイートによれば自殺した近畿財務局の調査官宅から文書Aが出てきたらしい