簡単にまとめてみた

○国家戦略特区諮問会議(安倍が居る所)
  「1校に限る」とか特区認定などに係わる告示などに関する疑問点はここに聞く

○国家戦略特区会議(区域会議)
 特区事業の受付や自治体との交渉、特区認定の決定に係わることはここに聞く

○ワーキンググループ
 特区事業の妥当性の判断や各省庁との折衝の内容に関してはここに聞く

○文科省
 学校設置の審査や審査条件に関してはここに聞く

○自治体
 事業者の選定や提案内容に関してはここに聞く

上のようにそれぞれ権限が分散されているのに、野党やマスゴミは全部総理に答えさそうとして、
さらに全部総理が関与しているかのように印象操作をしているんだよな。