>>808
行政手続において許認可は

①許認可権限を持つ側（この場合文科省）認可に必要な審査基準をあらかじめ具体的に提示しておかなくてはならない
　（行政手続法第５条）

②申請者が所轄省庁に申請を出す

③認可権限を持つ側は申請を拒否する場合はその理由を示さなければならない
　（行政手続法第８条）

文科省は①ができてなかったんだよ。だから③もできない