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木曜朝のフジ「とくダネ」で時事通信の田崎史郎が
　「これは獣医学科が無い四国へ誘致を希望する地元側と
　獣医学部大学を増やしたくない文科省という構造の中に、
　首相肝いりの戦略特区で推し進めようとする内閣府側との対立したやりとり文書だろう。
　官邸側はどの人物がリーク流出させたか調べてて、
　文科省内で問題を起こして処分されて逆恨みした元官僚が浮上している」と解説してた。

こちらの記事も参考に

■加計学園問題「怪文書」仕掛け人は、「官邸に恨みを持つ元文科省幹部」

（永田町関係者）「朝日新聞以外の新聞社とテレビ局にも提供し、一部野党にも渡したようだ。
　提供相手に傾向があるため、憲法改正阻止に向けた政局誘導、情報操作を狙っている可能性がある。
　官邸は現在、元幹部とつながる政界・官界関係者を詳しく調べている。」

これに文科省側は戦々恐々となっている。天下り問題で歴代事務次官らが処分されたばかりで、
今回の文書問題に霞が関での信頼はさらに失墜し、ある同省幹部は「これから粛正が始まる・・・」とおびえている。
http://www.zakzak.co.jp/society/politics/news/20170519/plt1705191100003-n2.htm

なお、文科省 天下りは、民主党政権が容認させたていたブーメラン案件な。
http://i.imgur.com/aciQTJI.jpg