原作者が原作の内容のままにして欲しい、という希望を
伝えたのに、どこで歪みが生じたのかが謎。

1.そもそも、脚本家に伝わってなかった
2.小学館または日テレまたはこの双方が、最初から
  原作者の希望どおりにするつもりがなかった
3.脚本家には伝わっていたが、脚本家が暴走した

考えられるのは、この3つくらいかな?