もしも会社から不当な扱いを受けて、それが労働法違反だと判ったらどうすれば良いのでしょうか？

証拠集めや会社との交渉自体は自分自身で行う必要がありますが、やはり公的機関のバックアップは欲しいところです。

労働基準法に関する公的機関と言えば労働基準監督署。
泥棒の被害にあったら警察へ行くように、
火事が起きたら消防署に行くように、
労働法違反についての相談なら労働基準監督署へ相談に行きましょう。
http://www.roudousha.net/kiso/Work2-kiso004.html